Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP9O43818 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP9O43818 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP9O43818 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP9O43818 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP9O43818 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP9O43818 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP9O43818 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP9O43818 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP9O43818 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP9O43818 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRP9O43818 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRP9O43818 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRP9O43818 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRP9O43818 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRP9O43818 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRP9O43818 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRP9O43818 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRP9O43818 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRP9O43818 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRP9O43818 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP9O43818 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP9O43818 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP9O43818 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP9O43818 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP9O43818 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP9O43818 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP9O43818 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP9O43818 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP9O43818 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP9O43818 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP9O43818 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP9O43818 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP9O43818 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP9O43818 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP9O43818 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP9O43818 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP9O43818 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP9O43818 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP9O43818 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP9O43818 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP9O43818 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP9O43818 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP9O43818 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP9O43818 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRP9O43818 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP9O43818 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP9O43818 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP9O43818 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP9O43818 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP9O43818 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP9O43818 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP9O43818 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP9O43818 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP9O43818 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP9O43818 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP9O43818 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP9O43818 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP9O43818 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP9O43818 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRP9O43818 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP9O43818 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP9O43818 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP9O43818 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP9O43818 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP9O43818 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP9O43818 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP9O43818 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP9O43818 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP9O43818 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP9O43818 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP9O43818 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP9O43818 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP9O43818 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRP9O43818 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP9O43818 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP9O43818 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP9O43818 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP9O43818 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP9O43818 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP9O43818 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP9O43818 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP9O43818 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP9O43818 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP9O43818 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP9O43818 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP9O43818 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRP9O43818 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP9O43818 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP9O43818 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP9O43818 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP9O43818 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP9O43818 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP9O43818 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP9O43818 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP9O43818 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP9O43818 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP9O43818 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP9O43818 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRP9O43818 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms