Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 CCNI-206ENST00000511943 576 ntTSL 34.01□□□□□ -1.773e-6■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 LONP1-209ENST00000590206 725 ntTSL 312.82□□□□□ -0.362e-8■■■■□ 23.2
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PRPF4O43172 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.236e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.26e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.066e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.016e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.056e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 ANKMY1-201ENST00000272972 3228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.356e-7■■■■□ 23.2
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PRPF4O43172 AXIN1-204ENST00000461023 6340 ntTSL 216.32■□□□□ 0.26e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 AXIN1-202ENST00000354866 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.296e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.267e-10■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 HMGCS1-202ENST00000433297 3466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.467e-10■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.915e-6■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.776e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.46e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 FAM117A-206ENST00000506156 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 323.71■■□□□ 1.395e-6■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.356e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.356e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.356e-7■■■■□ 23.2
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PRPF4O43172 PTGES2-203ENST00000449878 803 ntTSL 523.2■■□□□ 1.36e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 PNKP-220ENST00000627232 1530 ntTSL 522.76■■□□□ 1.236e-7■■■■□ 23.2
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PRPF4O43172 PTGES2-204ENST00000474124 873 ntTSL 522.05■■□□□ 1.126e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.016e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 SPHK2-203ENST00000426514 1493 ntTSL 1 (best)21.24■□□□□ 0.996e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 PNKP-203ENST00000593946 1723 ntTSL 1 (best)20.82■□□□□ 0.926e-7■■■■□ 23.2
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PRPF4O43172 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.796e-7■■■■□ 23.2
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PRPF4O43172 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.726e-7■■■■□ 23.2
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PRPF4O43172 EPHB4-207ENST00000489808 921 ntTSL 1 (best)18.17■□□□□ 0.56e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 SPHK2-212ENST00000601704 565 ntTSL 218.05■□□□□ 0.486e-7■■■■□ 23.2
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PRPF4O43172 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.436e-7■■■■□ 23.2
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PRPF4O43172 RAP1A-203ENST00000433097 666 ntTSL 516.07■□□□□ 0.166e-7■■■■□ 23.2
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PRPF4O43172 SFI1-212ENST00000452250 2625 ntTSL 215.14■□□□□ 0.016e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.016e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 FAM117A-205ENST00000505159 739 ntTSL 315□□□□□ -0.015e-6■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.016e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.026e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.036e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.056e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 SPHK2-204ENST00000593308 713 ntTSL 314.72□□□□□ -0.056e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.076e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 C7orf50-205ENST00000444428 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.51□□□□□ -0.096e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 PTGES2-210ENST00000487063 638 ntTSL 314.47□□□□□ -0.096e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.16e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 EPHB4-209ENST00000492878 769 ntTSL 514.38□□□□□ -0.116e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 SETDB1-206ENST00000423081 590 ntTSL 314.33□□□□□ -0.126e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 SFI1-214ENST00000464333 3019 ntTSL 214.29□□□□□ -0.126e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 WDR90-204ENST00000546516 3593 ntTSL 214.22□□□□□ -0.136e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.146e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 PNKP-221ENST00000627317 767 ntTSL 514.06□□□□□ -0.166e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 PNKP-202ENST00000593706 849 ntTSL 314.04□□□□□ -0.166e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 SFI1-219ENST00000474741 708 ntTSL 514□□□□□ -0.176e-7■■■■□ 23.2
PRPF4O43172 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.186e-7■■■■□ 23.2
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