Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO7DNF2Z398 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMO7DNF2Z398 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms