Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC1Q9Y5R8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms