Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
THRAP3Q9Y2W1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
THRAP3Q9Y2W1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms