Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ZNF608Q9ULD9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ZNF608Q9ULD9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms