Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms