Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.256e-9■■□□□ 12.8
AATFQ9NY61 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.226e-9■■□□□ 12.8
AATFQ9NY61 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.116e-9■■□□□ 12.8
AATFQ9NY61 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.841e-8■■□□□ 12.8
AATFQ9NY61 GPI-208ENST00000588991 2021 ntTSL 224■■□□□ 1.431e-8■■□□□ 12.8
AATFQ9NY61 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.411e-8■■□□□ 12.8
AATFQ9NY61 GPI-202ENST00000415930 4000 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.911e-8■■□□□ 12.8
AATFQ9NY61 RPSA-203ENST00000444512 701 ntTSL 223.04■■□□□ 1.281e-323■■□□□ 12.7
AATFQ9NY61 RPSA-206ENST00000477325 596 ntTSL 211.57□□□□□ -0.561e-323■■□□□ 12.7
AATFQ9NY61 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.49□□□□□ -2.011e-323■■□□□ 12.7
AATFQ9NY61 ACAP3-209ENST00000476572 819 ntTSL 519.22■□□□□ 0.672e-7■■□□□ 12.7
AATFQ9NY61 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.017e-7■■□□□ 12.7
AATFQ9NY61 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.757e-7■■□□□ 12.7
AATFQ9NY61 SREBF2-202ENST00000424354 5699 ntTSL 1 (best)15.12■□□□□ 0.017e-7■■□□□ 12.7
AATFQ9NY61 UBC-214ENST00000546271 559 ntTSL 414.6□□□□□ -0.072e-6■■□□□ 12.7
AATFQ9NY61 TRIM28-204ENST00000594806 861 ntTSL 531.21■■■□□ 2.595e-7■■□□□ 12.6
AATFQ9NY61 TRIM28-203ENST00000593582 533 ntTSL 318.64■□□□□ 0.575e-7■■□□□ 12.6
AATFQ9NY61 KMT5A-209ENST00000537270 352 ntTSL 521.23■□□□□ 0.993e-7■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 TCF25-222ENST00000568412 797 ntTSL 320.53■□□□□ 0.883e-7■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 TCF25-204ENST00000561958 763 ntTSL 320.53■□□□□ 0.883e-7■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.753e-7■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.653e-7■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 TCF25-221ENST00000568409 857 ntTSL 316.77■□□□□ 0.283e-7■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 TCF25-223ENST00000568870 263 ntTSL 216.77■□□□□ 0.283e-7■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 UQCRH-203ENST00000486951 687 ntTSL 315.56■□□□□ 0.083e-7■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 KMT5A-204ENST00000437519 1774 ntTSL 215.09■□□□□ 0.013e-7■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 UQCRH-201ENST00000311672 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.133e-7■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 TCF25-219ENST00000566751 383 ntTSL 510.05□□□□□ -0.83e-7■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 UQCRH-205ENST00000496387 674 ntTSL 1 (best)7.05□□□□□ -1.283e-7■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 UQCRH-204ENST00000489056 553 ntTSL 24.63□□□□□ -1.673e-7■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 BSG-209ENST00000574970 570 ntTSL 426.57■■□□□ 1.844e-6■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 BSG-208ENST00000573784 559 ntTSL 423.4■■□□□ 1.344e-6■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 BSG-211ENST00000576984 544 ntTSL 422.72■■□□□ 1.234e-6■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.158e-7■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 NADK-205ENST00000460602 974 ntTSL 231.32■■■□□ 2.68e-7■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 NADK-212ENST00000492768 859 ntTSL 331.3■■■□□ 2.68e-7■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.588e-7■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 NADK-213ENST00000492845 937 ntTSL 222■■□□□ 1.118e-7■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.928e-7■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 CBX4-204ENST00000495122 490 ntTSL 318.85■□□□□ 0.618e-7■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.18e-7■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 NADK-204ENST00000378625 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.298e-7■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.248e-7■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.715e-6■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.555e-6■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.885e-6■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 YY1AP1-218ENST00000454523 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 220.53■□□□□ 0.885e-6■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 YY1AP1-217ENST00000443231 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 319.51■□□□□ 0.715e-6■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 YY1AP1-207ENST00000361140 2701 ntTSL 1 (best)18.91■□□□□ 0.625e-6■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 YY1AP1-221ENST00000476093 1037 ntTSL 318.46■□□□□ 0.555e-6■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.475e-6■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.445e-6■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 YY1AP1-220ENST00000476027 927 ntTSL 316.76■□□□□ 0.275e-6■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.095e-6■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.045e-6■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 YY1AP1-209ENST00000368330 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.275e-6■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 YY1AP1-204ENST00000354691 2498 ntTSL 212.98□□□□□ -0.335e-6■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 YY1AP1-203ENST00000347088 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.815e-6■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 YY1AP1-215ENST00000436865 2684 ntTSL 1 (best)9.87□□□□□ -0.835e-6■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 RPL32-205ENST00000434963 439 ntTSL 510.54□□□□□ -0.728e-8■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC8.25□□□□□ -1.098e-8■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.635e-19■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.55e-19■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 DKC1-210ENST00000481062 819 ntTSL 216.11■□□□□ 0.175e-19■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 DKC1-209ENST00000475966 902 ntTSL 511.91□□□□□ -0.55e-19■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 DKC1-204ENST00000426673 843 ntTSL 511.7□□□□□ -0.545e-19■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 DKC1-202ENST00000412124 670 ntTSL 58.77□□□□□ -1.015e-19■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.281e-323■■□□□ 12.5
AATFQ9NY61 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.562e-6■■□□□ 12.4
AATFQ9NY61 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.492e-6■■□□□ 12.4
AATFQ9NY61 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.82e-6■■□□□ 12.4
AATFQ9NY61 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.622e-6■■□□□ 12.4
AATFQ9NY61 HBG1-202ENST00000632727 369 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.932e-9■■□□□ 12.4
AATFQ9NY61 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.32e-9■■□□□ 12.4
AATFQ9NY61 ROR2-201ENST00000375708 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.358e-6■■□□□ 12.4
AATFQ9NY61 PTTG1IP-206ENST00000480234 398 ntTSL 324.85■■□□□ 1.575e-10■■□□□ 12.4
AATFQ9NY61 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.055e-10■■□□□ 12.4
AATFQ9NY61 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.025e-10■■□□□ 12.4
AATFQ9NY61 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.875e-10■■□□□ 12.4
AATFQ9NY61 PTTG1IP-207ENST00000494690 612 ntTSL 514.91□□□□□ -0.025e-10■■□□□ 12.4
AATFQ9NY61 ATXN2L-210ENST00000562867 609 ntTSL 222.05■■□□□ 1.128e-6■■□□□ 12.4
AATFQ9NY61 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.268e-6■■□□□ 12.4
AATFQ9NY61 ATXN2L-211ENST00000563314 4574 ntTSL 516.42■□□□□ 0.228e-6■■□□□ 12.4
AATFQ9NY61 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.178e-6■■□□□ 12.4
AATFQ9NY61 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.048e-6■■□□□ 12.4
AATFQ9NY61 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -08e-6■■□□□ 12.4
AATFQ9NY61 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.058e-6■■□□□ 12.4
AATFQ9NY61 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.098e-6■■□□□ 12.4
AATFQ9NY61 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.198e-6■■□□□ 12.4
AATFQ9NY61 DANCR-203ENST00000441504 336 ntTSL 221.51■■□□□ 1.031e-323■■□□□ 12.4
AATFQ9NY61 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.821e-323■■□□□ 12.4
AATFQ9NY61 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.67■□□□□ 0.587e-7■■□□□ 12.4
AATFQ9NY61 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.671e-6■■□□□ 12.3
AATFQ9NY61 BMP2K-202ENST00000389010 2741 ntTSL 1 (best)24.6■■□□□ 1.531e-6■■□□□ 12.3
AATFQ9NY61 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.011e-6■■□□□ 12.3
AATFQ9NY61 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.621e-6■■□□□ 12.3
AATFQ9NY61 SNHG3-203ENST00000447507 185 ntTSL 1 (best)0.18□□□□□ -2.381e-13■■□□□ 12.3
AATFQ9NY61 PTCD3-201ENST00000254630 6734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.842e-17■■□□□ 12.3
AATFQ9NY61 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC8.23□□□□□ -1.092e-17■■□□□ 12.3
AATFQ9NY61 PTCD3-216ENST00000487043 1054 ntTSL 33.95□□□□□ -1.782e-17■■□□□ 12.3
Retrieved 100 of 5,565 protein–RNA pairs in 161.4 ms