Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO28Q9NVF7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO28Q9NVF7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms