Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CD163L1Q9NR16 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CD163L1Q9NR16 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms