Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC31BQ9NQW1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC31BQ9NQW1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC31BQ9NQW1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC31BQ9NQW1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC31BQ9NQW1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC31BQ9NQW1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC31BQ9NQW1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC31BQ9NQW1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC31BQ9NQW1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC31BQ9NQW1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC31BQ9NQW1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC31BQ9NQW1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC31BQ9NQW1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC31BQ9NQW1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC31BQ9NQW1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC31BQ9NQW1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC31BQ9NQW1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC31BQ9NQW1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC31BQ9NQW1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC31BQ9NQW1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC31BQ9NQW1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC31BQ9NQW1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC31BQ9NQW1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC31BQ9NQW1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC31BQ9NQW1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC31BQ9NQW1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC31BQ9NQW1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC31BQ9NQW1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC31BQ9NQW1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC31BQ9NQW1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC31BQ9NQW1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC31BQ9NQW1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC31BQ9NQW1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC31BQ9NQW1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms