Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM12Q9H4Q4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms