Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMG9Q9H0W8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG9Q9H0W8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
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