Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNTNAP4Q9C0A0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms