Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIOK1Q9BRS2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms