Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEDD1Q8NHV4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD1Q8NHV4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms