Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHCHD4Q8N4Q1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHCHD4Q8N4Q1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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