Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNIP4Q6PIL6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP4Q6PIL6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms