Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC70Q6NSX1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC70Q6NSX1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms