Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC8EQ6NSJ5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC8EQ6NSJ5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC8EQ6NSJ5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC8EQ6NSJ5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC8EQ6NSJ5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC8EQ6NSJ5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC8EQ6NSJ5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC8EQ6NSJ5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC8EQ6NSJ5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC8EQ6NSJ5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC8EQ6NSJ5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC8EQ6NSJ5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC8EQ6NSJ5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC8EQ6NSJ5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC8EQ6NSJ5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC8EQ6NSJ5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC8EQ6NSJ5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC8EQ6NSJ5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC8EQ6NSJ5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC8EQ6NSJ5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC8EQ6NSJ5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC8EQ6NSJ5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC8EQ6NSJ5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC8EQ6NSJ5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC8EQ6NSJ5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC8EQ6NSJ5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms