Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSR9

SPANXN1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N1, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN1Q5VSR9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPANXN1Q5VSR9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPANXN1Q5VSR9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPANXN1Q5VSR9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPANXN1Q5VSR9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPANXN1Q5VSR9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPANXN1Q5VSR9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPANXN1Q5VSR9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPANXN1Q5VSR9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPANXN1Q5VSR9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPANXN1Q5VSR9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPANXN1Q5VSR9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPANXN1Q5VSR9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPANXN1Q5VSR9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPANXN1Q5VSR9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPANXN1Q5VSR9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPANXN1Q5VSR9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPANXN1Q5VSR9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPANXN1Q5VSR9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPANXN1Q5VSR9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms