Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIK5Q16478 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
GRIK5Q16478 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GRIK5Q16478 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GRIK5Q16478 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIK5Q16478 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIK5Q16478 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIK5Q16478 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIK5Q16478 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIK5Q16478 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIK5Q16478 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIK5Q16478 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIK5Q16478 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIK5Q16478 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIK5Q16478 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIK5Q16478 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIK5Q16478 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIK5Q16478 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
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