Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNCBQ16143 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms