Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USF2Q15853 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USF2Q15853 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
USF2Q15853 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
USF2Q15853 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USF2Q15853 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USF2Q15853 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USF2Q15853 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USF2Q15853 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USF2Q15853 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USF2Q15853 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USF2Q15853 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USF2Q15853 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USF2Q15853 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USF2Q15853 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USF2Q15853 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USF2Q15853 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USF2Q15853 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USF2Q15853 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USF2Q15853 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USF2Q15853 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USF2Q15853 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USF2Q15853 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USF2Q15853 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
USF2Q15853 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USF2Q15853 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USF2Q15853 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USF2Q15853 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USF2Q15853 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USF2Q15853 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USF2Q15853 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USF2Q15853 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USF2Q15853 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USF2Q15853 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USF2Q15853 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USF2Q15853 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USF2Q15853 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USF2Q15853 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USF2Q15853 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USF2Q15853 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USF2Q15853 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USF2Q15853 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
USF2Q15853 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USF2Q15853 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USF2Q15853 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USF2Q15853 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USF2Q15853 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USF2Q15853 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USF2Q15853 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
USF2Q15853 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USF2Q15853 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USF2Q15853 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USF2Q15853 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USF2Q15853 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USF2Q15853 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USF2Q15853 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USF2Q15853 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USF2Q15853 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USF2Q15853 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USF2Q15853 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USF2Q15853 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USF2Q15853 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USF2Q15853 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USF2Q15853 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USF2Q15853 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USF2Q15853 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USF2Q15853 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USF2Q15853 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USF2Q15853 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USF2Q15853 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USF2Q15853 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USF2Q15853 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USF2Q15853 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USF2Q15853 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USF2Q15853 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USF2Q15853 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USF2Q15853 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USF2Q15853 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USF2Q15853 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USF2Q15853 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USF2Q15853 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USF2Q15853 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USF2Q15853 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USF2Q15853 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USF2Q15853 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USF2Q15853 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USF2Q15853 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USF2Q15853 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USF2Q15853 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USF2Q15853 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USF2Q15853 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USF2Q15853 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USF2Q15853 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USF2Q15853 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USF2Q15853 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USF2Q15853 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USF2Q15853 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USF2Q15853 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USF2Q15853 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USF2Q15853 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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