Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
UBE4AQ14139 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE4AQ14139 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms