Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
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