Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 MRPL3-209ENST00000511168 1377 ntTSL 221.46■■□□□ 1.031e-7■■■□□ 15.2
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G3BP1Q13283 DDX27-202ENST00000462328 824 ntTSL 521.01■□□□□ 0.951e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.891e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 CHCHD3-202ENST00000423635 1310 ntTSL 1 (best)20.54■□□□□ 0.881e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.61e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.591e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.581e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.531e-6■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 MYLK-212ENST00000508240 820 ntTSL 416.91■□□□□ 0.31e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC16.52■□□□□ 0.241e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.141e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.011e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 KIAA0368-202ENST00000338205 7078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.141e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 SEC24D-201ENST00000280551 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.431e-6■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 CHCHD3-206ENST00000496427 721 ntTSL 58.48□□□□□ -1.051e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 SEC24D-210ENST00000511033 576 ntTSL 46.17□□□□□ -1.421e-6■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.451e-6■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 CHD8-207ENST00000554384 735 ntTSL 35.76□□□□□ -1.491e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 SEC24D-214ENST00000514561 3806 ntTSL 1 (best)5.73□□□□□ -1.491e-6■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 CHCHD3-205ENST00000481152 1367 ntTSL 25.62□□□□□ -1.511e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 SEC24D-206ENST00000505134 3915 ntTSL 25.61□□□□□ -1.511e-6■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 MRPL3-206ENST00000510043 640 ntTSL 23.93□□□□□ -1.781e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.056e-8■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 GPI-208ENST00000588991 2021 ntTSL 225.13■■□□□ 1.616e-8■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.566e-8■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 NDUFV1-208ENST00000526770 1748 ntTSL 522.62■■□□□ 1.211e-8■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.941e-8■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.871e-8■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.851e-8■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.621e-8■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.025e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.657e-8■■■□□ 15.1
G3BP1Q13283 ACY1-224ENST00000637349 703 ntTSL 518.48■□□□□ 0.555e-7■■■□□ 15.1
G3BP1Q13283 ACY1-203ENST00000465121 1600 ntTSL 217.45■□□□□ 0.385e-7■■■□□ 15.1
G3BP1Q13283 SMARCA1-204ENST00000478420 561 ntTSL 34.13□□□□□ -1.754e-9■■■□□ 15.1
G3BP1Q13283 ACTN4-206ENST00000489451 654 ntTSL 314.48□□□□□ -0.091e-14■■■□□ 15.1
G3BP1Q13283 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.325e-9■■■□□ 15.1
G3BP1Q13283 GPT2-202ENST00000440783 4228 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.015e-9■■■□□ 15.1
G3BP1Q13283 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.022e-7■■■□□ 15.1
G3BP1Q13283 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.376e-6■■■□□ 15.1
G3BP1Q13283 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.226e-6■■■□□ 15.1
G3BP1Q13283 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.196e-6■■■□□ 15.1
G3BP1Q13283 NRDC-203ENST00000440943 1660 ntTSL 59.64□□□□□ -0.876e-6■■■□□ 15.1
G3BP1Q13283 NRDC-210ENST00000485608 3149 ntTSL 28.63□□□□□ -1.036e-6■■■□□ 15.1
G3BP1Q13283 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.256e-6■■■□□ 15.1
G3BP1Q13283 KDM5B-204ENST00000456180 558 ntTSL 43.96□□□□□ -1.782e-6■■■□□ 15.1
G3BP1Q13283 PCCB-212ENST00000474833 921 ntTSL 518.01■□□□□ 0.472e-6■■■□□ 15.1
G3BP1Q13283 PCCB-213ENST00000475214 1295 ntTSL 212.57□□□□□ -0.42e-6■■■□□ 15.1
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G3BP1Q13283 USP11-207ENST00000478596 970 ntTSL 317.62■□□□□ 0.413e-6■■■□□ 15.1
G3BP1Q13283 USP11-203ENST00000377080 804 ntTSL 212.02□□□□□ -0.493e-6■■■□□ 15.1
G3BP1Q13283 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.031e-6■■■□□ 15.1
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G3BP1Q13283 EIF4A1-209ENST00000578495 916 ntTSL 511.28□□□□□ -0.66e-10■■■□□ 15.1
G3BP1Q13283 PRDX2-203ENST00000466174 1717 ntTSL 1 (best)17.84■□□□□ 0.457e-8■■■□□ 15.1
G3BP1Q13283 PRDX2-201ENST00000301522 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.147e-8■■■□□ 15.1
G3BP1Q13283 PRDX2-202ENST00000334482 784 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.157e-8■■■□□ 15.1
G3BP1Q13283 HOOK2-213ENST00000589765 108 ntTSL 511.1□□□□□ -0.637e-8■■■□□ 15.1
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G3BP1Q13283 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.069e-7■■■□□ 15.1
G3BP1Q13283 CPSF2-205ENST00000556622 469 ntTSL 57.21□□□□□ -1.263e-6■■■□□ 15.1
G3BP1Q13283 EIF3D-211ENST00000478547 452 ntTSL 39.44□□□□□ -0.94e-7■■■□□ 15.1
G3BP1Q13283 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.356e-6■■■□□ 15.1
G3BP1Q13283 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.086e-6■■■□□ 15.1
G3BP1Q13283 ZMYM3-209ENST00000489332 5723 ntTSL 514.13□□□□□ -0.156e-6■■■□□ 15.1
G3BP1Q13283 ZMYM3-201ENST00000314425 5536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.416e-6■■■□□ 15.1
G3BP1Q13283 ZMYM3-205ENST00000373984 5253 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.476e-6■■■□□ 15.1
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G3BP1Q13283 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.225e-7■■■□□ 15.1
G3BP1Q13283 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.595e-7■■■□□ 15.1
G3BP1Q13283 KIF22-202ENST00000400751 2493 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.025e-7■■■□□ 15.1
G3BP1Q13283 UQCRC1-207ENST00000471189 955 ntTSL 316.35■□□□□ 0.211e-7■■■□□ 15.1
G3BP1Q13283 SF3B2-208ENST00000529994 1004 ntTSL 213.88□□□□□ -0.196e-8■■■□□ 15
G3BP1Q13283 CLUH-211ENST00000575014 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 521.85■■□□□ 1.091e-6■■■□□ 15
G3BP1Q13283 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.881e-6■■■□□ 15
G3BP1Q13283 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.631e-6■■■□□ 15
G3BP1Q13283 ALDH18A1-205ENST00000489386 543 ntTSL 37.24□□□□□ -1.252e-7■■■□□ 15
G3BP1Q13283 HSPA4-204ENST00000615899 2204 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.169e-9■■■□□ 15
G3BP1Q13283 CKB-203ENST00000553610 542 ntTSL 321.53■■□□□ 1.041e-6■■■□□ 15
G3BP1Q13283 USP11-202ENST00000377078 1077 ntTSL 521.23■□□□□ 0.992e-6■■■□□ 15
G3BP1Q13283 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.685e-9■■■□□ 15
G3BP1Q13283 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.55e-9■■■□□ 15
G3BP1Q13283 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.445e-9■■■□□ 15
G3BP1Q13283 GLUL-204ENST00000417584 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.045e-9■■■□□ 15
G3BP1Q13283 GLUL-207ENST00000463851 939 ntTSL 312.48□□□□□ -0.415e-9■■■□□ 15
G3BP1Q13283 GLUL-212ENST00000491322 6132 ntTSL 1 (best)11.99□□□□□ -0.495e-9■■■□□ 15
G3BP1Q13283 UBAP2L-209ENST00000437652 911 ntTSL 332.32■■■□□ 2.766e-7■■■□□ 15
G3BP1Q13283 UBAP2L-205ENST00000412596 980 ntTSL 531.74■■■□□ 2.676e-7■■■□□ 15
G3BP1Q13283 UBAP2L-204ENST00000368504 1120 ntTSL 516.99■□□□□ 0.316e-7■■■□□ 15
G3BP1Q13283 RALGAPB-206ENST00000461423 3830 ntTSL 25.79□□□□□ -1.485e-6■■■□□ 15
G3BP1Q13283 GTF3C1-201ENST00000356183 7018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.39e-7■■■□□ 15
G3BP1Q13283 GTF3C1-202ENST00000561623 7015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.459e-7■■■□□ 15
G3BP1Q13283 FLNA-213ENST00000466325 828 ntTSL 219.28■□□□□ 0.682e-10■■■□□ 15
G3BP1Q13283 FLNA-205ENST00000415241 704 ntTSL 518.69■□□□□ 0.582e-10■■■□□ 15
G3BP1Q13283 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.454e-6■■■□□ 15
G3BP1Q13283 RRM1-210ENST00000532170 3166 ntTSL 29.04□□□□□ -0.964e-6■■■□□ 15
G3BP1Q13283 RRM1-212ENST00000533349 2863 ntTSL 28.16□□□□□ -1.14e-6■■■□□ 15
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