Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.699e-7■■■■■ 27.4
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TARDBPQ13148 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.459e-7■■■■■ 27.4
TARDBPQ13148 IMMP2L-209ENST00000489381 856 ntTSL 55.71□□□□□ -1.57e-7■■■■■ 27.4
TARDBPQ13148 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.667e-7■■■■■ 27.4
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TARDBPQ13148 IFT140-207ENST00000566052 544 ntTSL 215.19■□□□□ 0.025e-8■■■■■ 27.4
TARDBPQ13148 IFT140-211ENST00000569812 452 ntTSL 514.25□□□□□ -0.135e-8■■■■■ 27.4
TARDBPQ13148 IFT140-204ENST00000439987 2580 ntTSL 213.84□□□□□ -0.195e-8■■■■■ 27.4
TARDBPQ13148 KIAA1958-202ENST00000374244 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.395e-8■■■■■ 27.4
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TARDBPQ13148 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.465e-8■■■■■ 27.4
TARDBPQ13148 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.495e-8■■■■■ 27.4
TARDBPQ13148 TNRC6C-201ENST00000301624 9632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.535e-8■■■■■ 27.4
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TARDBPQ13148 IFT140-202ENST00000397417 4023 ntTSL 510.77□□□□□ -0.695e-8■■■■■ 27.4
TARDBPQ13148 ZMIZ1-204ENST00000478357 4252 ntTSL 29.76□□□□□ -0.855e-8■■■■■ 27.4
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TARDBPQ13148 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.285e-8■■■■■ 27.4
TARDBPQ13148 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.239e-8■■■■■ 27.4
TARDBPQ13148 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.389e-8■■■■■ 27.4
TARDBPQ13148 FAM129A-201ENST00000367511 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.912e-6■■■■■ 27.4
TARDBPQ13148 PTTG1IP-206ENST00000480234 398 ntTSL 320.58■□□□□ 0.894e-7■■■■■ 27.4
TARDBPQ13148 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 27.4
TARDBPQ13148 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.513e-7■■■■■ 27.4
TARDBPQ13148 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.07□□□□□ -1.449e-8■■■■■ 27.4
TARDBPQ13148 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.742e-9■■■■■ 27.4
TARDBPQ13148 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.426e-7■■■■■ 27.4
TARDBPQ13148 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.136e-7■■■■■ 27.4
TARDBPQ13148 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.281e-6■■■■■ 27.3
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TARDBPQ13148 PCGF3-210ENST00000482726 538 ntTSL 421.36■■□□□ 1.011e-6■■■■■ 27.3
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TARDBPQ13148 PCGF3-203ENST00000419774 589 ntTSL 517.46■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 27.3
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TARDBPQ13148 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.281e-6■■■■■ 27.3
TARDBPQ13148 SND1-209ENST00000470723 568 ntTSL 412.16□□□□□ -0.461e-7■■■■■ 27.3
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TARDBPQ13148 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.832e-7■■■■■ 27.3
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TARDBPQ13148 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.642e-7■■■■■ 27.3
TARDBPQ13148 C7orf50-207ENST00000488073 853 ntTSL 518.31■□□□□ 0.522e-7■■■■■ 27.3
TARDBPQ13148 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.492e-7■■■■■ 27.3
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TARDBPQ13148 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.561e-7■■■■■ 27.2
TARDBPQ13148 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 27.2
TARDBPQ13148 RAPGEF2-206ENST00000505478 838 ntTSL 54.94□□□□□ -1.624e-7■■■■■ 27.2
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TARDBPQ13148 CCDC32-214ENST00000561011 1577 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 27.2
TARDBPQ13148 CCDC32-208ENST00000559153 1918 ntTSL 1 (best)11.94□□□□□ -0.51e-6■■■■■ 27.2
TARDBPQ13148 CCDC32-209ENST00000559291 6131 ntTSL 59.64□□□□□ -0.871e-6■■■■■ 27.2
TARDBPQ13148 CCDC32-212ENST00000560305 557 ntTSL 4 BASIC8.8□□□□□ -11e-6■■■■■ 27.2
TARDBPQ13148 CCDC32-210ENST00000559911 677 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.21e-6■■■■■ 27.2
TARDBPQ13148 CCDC32-203ENST00000558113 576 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.211e-6■■■■■ 27.2
TARDBPQ13148 ALG13-217ENST00000486578 686 ntTSL 24.13□□□□□ -1.759e-7■■■■■ 27.2
TARDBPQ13148 ALG13-205ENST00000460092 520 ntTSL 32.03□□□□□ -2.089e-7■■■■■ 27.2
TARDBPQ13148 CMIP-206ENST00000565029 1559 ntTSL 1 (best)14.34□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 27.2
TARDBPQ13148 FAM208B-205ENST00000473789 506 ntTSL 524.37■■□□□ 1.495e-9■■■■■ 27.1
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TARDBPQ13148 FAM208B-213ENST00000532424 433 ntTSL 321.82■■□□□ 1.085e-9■■■■■ 27.1
TARDBPQ13148 FAM208B-207ENST00000480839 540 ntTSL 319.38■□□□□ 0.695e-9■■■■■ 27.1
TARDBPQ13148 FAM208B-206ENST00000477043 514 ntTSL 216.67■□□□□ 0.265e-9■■■■■ 27.1
TARDBPQ13148 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.195e-9■■■■■ 27.1
TARDBPQ13148 WASF2-202ENST00000618852 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.477e-7■■■■■ 27.1
TARDBPQ13148 WASF2-201ENST00000536657 1083 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.137e-7■■■■■ 27.1
TARDBPQ13148 FUS-213ENST00000570090 544 ntTSL 218.79■□□□□ 0.65e-8■■■■■ 27.1
TARDBPQ13148 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.74□□□□□ -1.652e-9■■■■■ 27.1
TARDBPQ13148 SH3D21-202ENST00000474766 2043 ntTSL 1 (best)20.15■□□□□ 0.821e-7■■■■■ 27.1
TARDBPQ13148 SH3D21-203ENST00000480549 3182 ntTSL 215.92■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 27.1
TARDBPQ13148 RABGAP1L-209ENST00000457696 1847 ntTSL 1 (best)13.53□□□□□ -0.246e-7■■■■■ 27.1
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