Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.2■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
HSPB3Q12988 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms