Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.211e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 POFUT1-204ENST00000465791 768 ntTSL 313.6□□□□□ -0.231e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 NT5DC1-203ENST00000419791 667 ntTSL 313.6□□□□□ -0.234e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.263e-23■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.271e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.271e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 GNA12-205ENST00000471281 1205 ntTSL 313.31□□□□□ -0.281e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 CPSF6-204ENST00000547486 872 ntTSL 213.29□□□□□ -0.281e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 DOT1L-205ENST00000478937 638 ntTSL 313.22□□□□□ -0.291e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.321e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 RNF216P1-202ENST00000404006 2201 ntTSL 1 (best)13.01□□□□□ -0.331e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 NAP1L1-214ENST00000548273 818 ntTSL 312.89□□□□□ -0.353e-23■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 PGPEP1-208ENST00000600283 1414 ntTSL 1 (best)12.86□□□□□ -0.351e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.41e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 SNX10-201ENST00000338523 2546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.411e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.431e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.443e-23■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 AMDHD1-202ENST00000548310 1841 ntTSL 1 (best)12.2□□□□□ -0.461e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 N4BP1-202ENST00000564124 2485 ntTSL 512.12□□□□□ -0.473e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 NAP1L1-217ENST00000549988 544 ntTSL 312.09□□□□□ -0.473e-23■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 NAP1L1-206ENST00000544816 1597 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.483e-23■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 CPSF6-201ENST00000266679 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.491e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.511e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 GPATCH8-211ENST00000635257 5602 ntTSL 511.32□□□□□ -0.61e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 GMDS-210ENST00000533279 817 ntTSL 511.22□□□□□ -0.611e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 PLOD1-201ENST00000196061 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.621e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 LIMK2-202ENST00000333611 3462 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.641e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 PDXK-209ENST00000467908 7194 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.651e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 NAP1L1-210ENST00000547773 1967 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.653e-23■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 NAP1L1-205ENST00000542344 1675 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.663e-23■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 DENND1A-206ENST00000473039 4800 ntTSL 1 (best)10.84□□□□□ -0.671e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 AC130895.1-201ENST00000549373 493 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.681e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 NAP1L1-215ENST00000549479 573 ntTSL 210.67□□□□□ -0.73e-23■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 MBD5-206ENST00000473478 484 ntTSL 410.47□□□□□ -0.731e-6■■■■□ 22.3
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ILF3Q12906 DENND1A-212ENST00000497135 1207 ntTSL 510.35□□□□□ -0.751e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 RNGTT-201ENST00000369475 1725 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.81e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 NAP1L1-213ENST00000548044 1339 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.83e-23■■■■□ 22.3
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ILF3Q12906 RABGGTB-201ENST00000319942 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.851e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 NAP1L1-216ENST00000549596 1838 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.853e-23■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 ATAD1-201ENST00000308448 4640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.861e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 PDXK-216ENST00000481512 583 ntTSL 59.67□□□□□ -0.861e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 SUFU-203ENST00000423559 2601 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.871e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 NAP1L1-207ENST00000547479 623 ntTSL 59.59□□□□□ -0.873e-23■■■■□ 22.3
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ILF3Q12906 NAP1L1-203ENST00000431879 2031 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.883e-23■■■■□ 22.3
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ILF3Q12906 DENND1A-204ENST00000394215 1380 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.021e-6■■■■□ 22.3
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ILF3Q12906 DCTN5-206ENST00000566298 744 ntTSL 47.15□□□□□ -1.261e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 RNGTT-203ENST00000538899 1374 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.291e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.311e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.341e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.353e-23■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 TCF12-224ENST00000561346 852 ntTSL 26.54□□□□□ -1.361e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 TCF12-220ENST00000560887 540 ntTSL 46.54□□□□□ -1.361e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 RABGGTB-208ENST00000471759 2137 ntTSL 26.49□□□□□ -1.371e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 PIP4K2A-208ENST00000605011 558 ntTSL 46.46□□□□□ -1.381e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.41e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 MBD5-232ENST00000638090 2039 ntTSL 56.27□□□□□ -1.411e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.411e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 NT5DC1-204ENST00000460749 907 ntTSL 56.21□□□□□ -1.424e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 ZNF552-202ENST00000594473 335 ntTSL 26.15□□□□□ -1.421e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 SNX10-205ENST00000412416 429 ntTSL 35.94□□□□□ -1.461e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 RABGGTB-212ENST00000491266 961 ntTSL 35.89□□□□□ -1.471e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 HERC4-206ENST00000427635 6391 ntTSL 25.78□□□□□ -1.481e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 HERC4-209ENST00000473533 3593 ntTSL 1 (best)5.72□□□□□ -1.491e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 TCF12-211ENST00000559216 475 ntTSL 45.57□□□□□ -1.521e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 HGD-207ENST00000485313 528 ntTSL 55.57□□□□□ -1.524e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 NAP1L1-219ENST00000551500 552 ntTSL 1 (best)5.33□□□□□ -1.563e-23■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.561e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 HGD-205ENST00000476082 462 ntTSL 55.23□□□□□ -1.574e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.581e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.581e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 RABGGTB-209ENST00000473406 721 ntTSL 55.13□□□□□ -1.591e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.591e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 DNAH14-213ENST00000453375 456 ntTSL 25.01□□□□□ -1.611e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.613e-23■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 LMNB1-208ENST00000504788 1801 ntTSL 24.82□□□□□ -1.641e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 UBE3D-202ENST00000369746 2740 ntTSL 1 (best)4.78□□□□□ -1.641e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 MBD5-210ENST00000496158 544 ntTSL 54.64□□□□□ -1.671e-6■■■■□ 22.3
ILF3Q12906 MBD5-216ENST00000635796 1371 ntTSL 54.53□□□□□ -1.681e-6■■■■□ 22.3
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