Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 VPS51YKR020W 495 nt3.61□□□□□ -1.83
TY1B-BRQ12193 MRD1YPR112C 2664 nt3.61□□□□□ -1.83
TY1B-BRQ12193 PNC1YGL037C 651 nt3.61□□□□□ -1.83
TY1B-BRQ12193 SIN3YOL004W 4611 nt3.6□□□□□ -1.83
TY1B-BRQ12193 KTR6YPL053C 1341 nt3.6□□□□□ -1.83
TY1B-BRQ12193 MYO3YKL129C 3819 nt3.6□□□□□ -1.83
TY1B-BRQ12193 VPS45YGL095C 1734 nt3.6□□□□□ -1.83
TY1B-BRQ12193 SRB5YGR104C 924 nt3.6□□□□□ -1.83
TY1B-BRQ12193 TTI2YJR136C 1266 nt3.6□□□□□ -1.83
TY1B-BRQ12193 ECM1YAL059W 639 nt3.6□□□□□ -1.83
TY1B-BRQ12193 UTP22YGR090W 3714 nt3.6□□□□□ -1.83
TY1B-BRQ12193 YEF3YLR249W 3135 nt3.59□□□□□ -1.83
TY1B-BRQ12193 KIP3YGL216W 2418 nt3.59□□□□□ -1.83
TY1B-BRQ12193 SIC1YLR079W 855 nt3.59□□□□□ -1.83
TY1B-BRQ12193 ECI1YLR284C 843 nt3.59□□□□□ -1.83
TY1B-BRQ12193 DUN1YDL101C 1542 nt3.59□□□□□ -1.83
TY1B-BRQ12193 QCR10YHR001W-A 234 nt3.58□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 LSM8YJR022W 330 nt3.58□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 SPB1YCL054W 2526 nt3.58□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 MAK11YKL021C 1407 nt3.58□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 MEF1YLR069C 2286 nt3.58□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 YFL065CYFL065C 309 nt3.58□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 HSC82YMR186W 2118 nt3.58□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 MGM1YOR211C 2646 nt3.58□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 GCV2YMR189W 3105 nt3.58□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 PDR5YOR153W 4536 nt3.57□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 BRP1YGL007W 378 nt3.57□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 IES3YLR052W 753 nt3.57□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 ARG80YMR042W 534 nt3.57□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 YNR062CYNR062C 984 nt3.57□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 MCM16YPR046W 546 nt3.57□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 CDC20YGL116W 1833 nt3.57□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 ULS1YOR191W 4860 nt3.57□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 ATG1YGL180W 2694 nt3.56□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 NUP170YBL079W 4509 nt3.56□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 SRO77YBL106C 3033 nt3.56□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 CLN3YAL040C 1743 nt3.56□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 EMP24YGL200C 612 nt3.56□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 IKS1YJL057C 2004 nt3.55□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 KSP1YHR082C 3090 nt3.55□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 ROT1YMR200W 771 nt3.55□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 MAL32YBR299W 1755 nt3.54□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 RIM1YCR028C-A 408 nt3.54□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 NUP100YKL068W 2880 nt3.54□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 BCK2YER167W 2556 nt3.53□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 GIP4YAL031C 2283 nt3.53□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 VIP1YLR410W 3441 nt3.53□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 PEX4YGR133W 552 nt3.53□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 SRL3YKR091W 741 nt3.53□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 SEC66YBR171W 621 nt3.53□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 GZF3YJL110C 1656 nt3.53□□□□□ -1.84
TY1B-BRQ12193 GLO1YML004C 981 nt3.52□□□□□ -1.85
TY1B-BRQ12193 PNO1YOR145C 825 nt3.52□□□□□ -1.85
TY1B-BRQ12193 SSE1YPL106C 2082 nt3.51□□□□□ -1.85
TY1B-BRQ12193 YMR018WYMR018W 1545 nt3.51□□□□□ -1.85
TY1B-BRQ12193 AIM32YML050W 936 nt3.51□□□□□ -1.85
TY1B-BRQ12193 ERV41YML067C 1059 nt3.51□□□□□ -1.85
TY1B-BRQ12193 ALK2YBL009W 2031 nt3.51□□□□□ -1.85
TY1B-BRQ12193 MOB2YFL034C-B 864 nt3.51□□□□□ -1.85
TY1B-BRQ12193 ORM2YLR350W 651 nt3.51□□□□□ -1.85
TY1B-BRQ12193 SRT1YMR101C 1032 nt3.51□□□□□ -1.85
TY1B-BRQ12193 GYP5YPL249C 2685 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1B-BRQ12193 SIN4YNL236W 2925 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1B-BRQ12193 ATG23YLR431C 1362 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1B-BRQ12193 SLM5YCR024C 1479 nt3.49□□□□□ -1.85
TY1B-BRQ12193 SSD1YDR293C 3753 nt3.49□□□□□ -1.85
TY1B-BRQ12193 SPT16YGL207W 3108 nt3.49□□□□□ -1.85
TY1B-BRQ12193 CDC9YDL164C 2268 nt3.49□□□□□ -1.85
TY1B-BRQ12193 DLS1YJL065C 504 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1B-BRQ12193 TAO3YIL129C 7131 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1B-BRQ12193 SMC2YFR031C 3513 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1B-BRQ12193 PRM7YDL039C 2097 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1B-BRQ12193 YGL024WYGL024W 336 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1B-BRQ12193 EMG1YLR186W 759 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1B-BRQ12193 RPN1YHR027C 2982 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1B-BRQ12193 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1B-BRQ12193 BYE1YKL005C 1785 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1B-BRQ12193 QRI7YDL104C 1224 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1B-BRQ12193 SPT2YER161C 1002 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1B-BRQ12193 YJR098CYJR098C 1971 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1B-BRQ12193 GIS4YML006C 2325 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1B-BRQ12193 GAL80YML051W 1308 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1B-BRQ12193 GCN4YEL009C 846 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1B-BRQ12193 RPL27AYHR010W 411 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1B-BRQ12193 YLR125WYLR125W 411 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1B-BRQ12193 REV3YPL167C 4515 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1B-BRQ12193 MSA1YOR066W 1890 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1B-BRQ12193 DIS3YOL021C 3006 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1B-BRQ12193 YGL188CYGL188C 174 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1B-BRQ12193 YPT53YNL093W 663 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1B-BRQ12193 INO4YOL108C 456 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1B-BRQ12193 GCN1YGL195W 8019 nt3.44□□□□□ -1.86
TY1B-BRQ12193 SIP18YMR175W 240 nt3.44□□□□□ -1.86
TY1B-BRQ12193 RPC34YNR003C 954 nt3.44□□□□□ -1.86
TY1B-BRQ12193 RTS1YOR014W 2274 nt3.44□□□□□ -1.86
TY1B-BRQ12193 NSP1YJL041W 2472 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1B-BRQ12193 IRC8YJL051W 2469 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1B-BRQ12193 NOP13YNL175C 1212 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1B-BRQ12193 CST9YLR394W 1449 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1B-BRQ12193 GEP4YHR100C 558 nt3.43□□□□□ -1.86
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