Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
ATP7AQ04656 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ATP7AQ04656 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
ATP7AQ04656 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms