Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUCB1Q02818 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUCB1Q02818 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUCB1Q02818 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms