Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTN2Q02246 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN2Q02246 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms