Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPIBQ01892 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPIBQ01892 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms