Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHBDL3P58872 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RHBDL3P58872 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms