Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 PHF21A-204ENST00000525438 577 ntTSL 44.43□□□□□ -1.72e-6■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 PHF21A-203ENST00000524497 555 ntTSL 54.17□□□□□ -1.742e-6■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 PHF21A-210ENST00000528893 457 ntTSL 33.59□□□□□ -1.832e-6■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 TBL1XR1-230ENST00000637123 138 ntTSL 52.68□□□□□ -1.982e-8■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.421e-6■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 KDM2A-207ENST00000526258 5671 ntTSL 1 (best)14.97□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 KDM2A-201ENST00000308783 3666 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 KDM2A-205ENST00000525041 697 ntTSL 413.09□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 KDM2A-213ENST00000531696 4160 ntTSL 512.65□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.343e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.343e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.823e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.653e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 ZNRF1-203ENST00000564320 607 ntTSL 314.01□□□□□ -0.173e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 TBCD-210ENST00000572953 702 ntTSL 518.02■□□□□ 0.485e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 TBCD-217ENST00000574975 867 ntTSL 516.46■□□□□ 0.235e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 TMLHE-201ENST00000334398 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.172e-6■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 TMLHE-205ENST00000474677 298 ntTSL 35.75□□□□□ -1.492e-6■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 UBE2K-207ENST00000513231 871 ntTSL 1 (best)38.06■■■■□ 3.682e-6■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 UBE2K-206ENST00000510934 589 ntTSL 232.57■■■□□ 2.82e-6■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.612e-6■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.012e-6■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 UBE2K-202ENST00000438068 2262 ntTSL 226.15■■□□□ 1.782e-6■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.592e-6■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 UBE2K-205ENST00000510719 566 ntTSL 313.26□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 TBCD-214ENST00000574801 586 ntTSL 420.71■□□□□ 0.911e-6■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 ZRANB1-201ENST00000359653 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.896e-7■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 28.1
HNRNPMP52272 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.064e-8■■■■■ 28
HNRNPMP52272 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.994e-8■■■■■ 28
HNRNPMP52272 POLD2-204ENST00000433715 765 ntTSL 332.83■■■□□ 2.854e-8■■■■■ 28
HNRNPMP52272 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.314e-8■■■■■ 28
HNRNPMP52272 POLD2-206ENST00000436844 854 ntTSL 528.93■■■□□ 2.224e-8■■■■■ 28
HNRNPMP52272 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.084e-8■■■■■ 28
HNRNPMP52272 POLD2-213ENST00000470867 678 ntTSL 526.48■■□□□ 1.834e-8■■■■■ 28
HNRNPMP52272 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.63e-8■■■■■ 28
HNRNPMP52272 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.734e-6■■■■■ 28
HNRNPMP52272 POLD2-210ENST00000463464 707 ntTSL 218.68■□□□□ 0.584e-8■■■■■ 28
HNRNPMP52272 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.174e-6■■■■■ 28
HNRNPMP52272 FAM193A-208ENST00000513350 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 214.84□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 28
HNRNPMP52272 AC004381.2-201ENST00000637768 1329 ntBASIC15.14■□□□□ 0.011e-9■■■■■ 28
HNRNPMP52272 ZNF562-203ENST00000585350 577 ntTSL 524.44■■□□□ 1.54e-11■■■■■ 28
HNRNPMP52272 ZNF562-208ENST00000590155 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.314e-11■■■■■ 28
HNRNPMP52272 ZNF562-207ENST00000589542 491 ntTSL 312.07□□□□□ -0.484e-11■■■■■ 28
HNRNPMP52272 ZNF562-206ENST00000588653 585 ntTSL 29.66□□□□□ -0.864e-11■■■■■ 28
HNRNPMP52272 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.964e-11■■■■■ 28
HNRNPMP52272 ZNF562-204ENST00000585688 1475 ntTSL 28.4□□□□□ -1.064e-11■■■■■ 28
HNRNPMP52272 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.394e-11■■■■■ 28
HNRNPMP52272 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.464e-11■■■■■ 28
HNRNPMP52272 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC24.1■■□□□ 1.458e-12■■■■■ 28
HNRNPMP52272 SMYD3-207ENST00000462422 971 ntTSL 520.17■□□□□ 0.826e-7■■■■■ 28
HNRNPMP52272 ZNF254-204ENST00000594886 792 ntTSL 215.33■□□□□ 0.041e-7■■■■■ 28
HNRNPMP52272 ZNF254-201ENST00000339642 511 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.191e-7■■■■■ 28
HNRNPMP52272 ZNF254-205ENST00000595187 611 ntTSL 411.94□□□□□ -0.51e-7■■■■■ 28
HNRNPMP52272 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.861e-7■■■■■ 28
HNRNPMP52272 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC9.07□□□□□ -0.961e-7■■■■■ 28
HNRNPMP52272 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.061e-7■■■■■ 28
HNRNPMP52272 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.431e-7■■■■■ 28
HNRNPMP52272 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.121e-6■■■■■ 28
HNRNPMP52272 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.881e-6■■■■■ 28
HNRNPMP52272 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.651e-6■■■■■ 28
HNRNPMP52272 OSBPL10-205ENST00000452791 485 ntTSL 331.1■■■□□ 2.573e-7■■■■■ 28
HNRNPMP52272 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.193e-7■■■■■ 28
HNRNPMP52272 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.573e-7■■■■■ 28
HNRNPMP52272 OSBPL10-216ENST00000480671 492 ntTSL 315.25■□□□□ 0.033e-7■■■■■ 28
HNRNPMP52272 OSBPL10-207ENST00000465626 473 ntTSL 29.68□□□□□ -0.863e-7■■■■■ 28
HNRNPMP52272 OSBPL10-214ENST00000479173 554 ntTSL 47.41□□□□□ -1.223e-7■■■■■ 28
HNRNPMP52272 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.421e-7■■■■■ 28
HNRNPMP52272 WRN-203ENST00000521620 3593 ntTSL 1 (best)5.04□□□□□ -1.67e-7■■■■■ 28
HNRNPMP52272 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.162e-6■■■■■ 28
HNRNPMP52272 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.122e-6■■■■■ 28
HNRNPMP52272 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.122e-6■■■■■ 28
HNRNPMP52272 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.012e-6■■■■■ 28
HNRNPMP52272 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.782e-6■■■■■ 28
HNRNPMP52272 LINC01446-201ENST00000380970 3484 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.133e-7■■■■■ 28
HNRNPMP52272 ELF2-209ENST00000511184 1766 ntTSL 542.1■■■■■ 4.333e-8■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 ELF2-208ENST00000511006 1434 ntTSL 1 (best)36.74■■■■□ 3.473e-8■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 IFNGR1-202ENST00000414770 748 ntTSL 336.41■■■■□ 3.423e-8■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 IFNGR1-204ENST00000478333 643 ntTSL 233.53■■■□□ 2.963e-8■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 IFNGR1-203ENST00000458076 753 ntTSL 325.66■■□□□ 1.73e-8■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 KDM5A-210ENST00000544760 2338 ntTSL 224.49■■□□□ 1.513e-8■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.363e-8■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.213e-8■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.943e-8■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 SPATA13-212ENST00000494772 301 ntTSL 518.72■□□□□ 0.593e-8■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 SARNP-201ENST00000336133 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.583e-8■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 SARNP-202ENST00000546604 1163 ntTSL 217.52■□□□□ 0.43e-8■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 SPATA13-207ENST00000434675 2001 ntTSL 216.72■□□□□ 0.273e-8■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 SRP68-203ENST00000542536 1714 ntTSL 216.67■□□□□ 0.263e-8■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 SRP68-212ENST00000602720 2037 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.243e-8■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 SARNP-205ENST00000552884 997 ntTSL 1 (best)11.84□□□□□ -0.513e-8■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 AC023055.1-201ENST00000546837 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.563e-8■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 KDM5A-201ENST00000399788 10763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.783e-8■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.653e-8■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 NPAT-205ENST00000531384 575 ntTSL 513.14□□□□□ -0.311e-7■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 NPAT-206ENST00000610253 3959 ntTSL 27.97□□□□□ -1.131e-7■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.161e-7■■■■■ 27.9
HNRNPMP52272 LBR-201ENST00000272163 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.49e-9■■■■■ 27.9
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 450.2 ms