Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRE11P49959 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRE11P49959 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRE11P49959 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRE11P49959 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRE11P49959 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRE11P49959 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRE11P49959 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRE11P49959 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRE11P49959 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MRE11P49959 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRE11P49959 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRE11P49959 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRE11P49959 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MRE11P49959 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRE11P49959 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRE11P49959 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRE11P49959 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRE11P49959 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRE11P49959 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRE11P49959 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRE11P49959 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRE11P49959 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRE11P49959 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRE11P49959 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRE11P49959 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRE11P49959 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRE11P49959 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRE11P49959 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRE11P49959 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRE11P49959 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRE11P49959 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MRE11P49959 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MRE11P49959 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MRE11P49959 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MRE11P49959 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MRE11P49959 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MRE11P49959 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MRE11P49959 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MRE11P49959 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MRE11P49959 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MRE11P49959 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MRE11P49959 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MRE11P49959 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRE11P49959 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRE11P49959 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRE11P49959 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRE11P49959 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRE11P49959 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRE11P49959 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRE11P49959 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRE11P49959 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRE11P49959 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRE11P49959 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRE11P49959 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRE11P49959 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRE11P49959 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRE11P49959 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRE11P49959 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRE11P49959 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRE11P49959 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRE11P49959 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRE11P49959 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRE11P49959 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRE11P49959 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRE11P49959 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRE11P49959 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRE11P49959 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRE11P49959 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRE11P49959 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRE11P49959 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRE11P49959 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRE11P49959 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRE11P49959 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRE11P49959 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRE11P49959 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRE11P49959 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRE11P49959 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRE11P49959 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRE11P49959 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRE11P49959 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRE11P49959 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRE11P49959 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRE11P49959 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRE11P49959 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRE11P49959 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRE11P49959 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRE11P49959 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRE11P49959 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRE11P49959 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRE11P49959 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRE11P49959 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRE11P49959 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRE11P49959 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRE11P49959 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRE11P49959 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MRE11P49959 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRE11P49959 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRE11P49959 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRE11P49959 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms