Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF6P49848 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF6P49848 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF6P49848 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF6P49848 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF6P49848 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF6P49848 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF6P49848 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF6P49848 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF6P49848 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF6P49848 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF6P49848 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF6P49848 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF6P49848 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF6P49848 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF6P49848 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF6P49848 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF6P49848 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF6P49848 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF6P49848 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF6P49848 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF6P49848 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF6P49848 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF6P49848 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF6P49848 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF6P49848 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF6P49848 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF6P49848 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF6P49848 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF6P49848 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF6P49848 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF6P49848 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF6P49848 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF6P49848 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF6P49848 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF6P49848 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF6P49848 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF6P49848 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF6P49848 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF6P49848 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF6P49848 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF6P49848 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF6P49848 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF6P49848 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF6P49848 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF6P49848 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF6P49848 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF6P49848 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF6P49848 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF6P49848 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF6P49848 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF6P49848 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF6P49848 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF6P49848 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF6P49848 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF6P49848 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF6P49848 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF6P49848 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF6P49848 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF6P49848 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF6P49848 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF6P49848 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF6P49848 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF6P49848 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF6P49848 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF6P49848 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF6P49848 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF6P49848 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF6P49848 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF6P49848 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF6P49848 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF6P49848 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF6P49848 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF6P49848 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF6P49848 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF6P49848 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF6P49848 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF6P49848 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF6P49848 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF6P49848 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF6P49848 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF6P49848 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF6P49848 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF6P49848 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF6P49848 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF6P49848 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF6P49848 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF6P49848 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF6P49848 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF6P49848 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF6P49848 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF6P49848 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF6P49848 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF6P49848 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF6P49848 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF6P49848 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF6P49848 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF6P49848 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF6P49848 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF6P49848 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms