Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP8P40818 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP8P40818 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP8P40818 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP8P40818 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP8P40818 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP8P40818 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP8P40818 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP8P40818 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP8P40818 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP8P40818 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP8P40818 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP8P40818 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP8P40818 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP8P40818 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP8P40818 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP8P40818 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP8P40818 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP8P40818 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP8P40818 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP8P40818 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP8P40818 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP8P40818 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP8P40818 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP8P40818 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP8P40818 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP8P40818 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP8P40818 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP8P40818 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP8P40818 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP8P40818 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP8P40818 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP8P40818 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP8P40818 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP8P40818 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP8P40818 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP8P40818 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP8P40818 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP8P40818 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP8P40818 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP8P40818 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP8P40818 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP8P40818 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP8P40818 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP8P40818 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP8P40818 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP8P40818 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP8P40818 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP8P40818 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP8P40818 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP8P40818 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP8P40818 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP8P40818 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP8P40818 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP8P40818 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP8P40818 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP8P40818 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP8P40818 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP8P40818 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP8P40818 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP8P40818 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP8P40818 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP8P40818 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP8P40818 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP8P40818 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP8P40818 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP8P40818 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP8P40818 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP8P40818 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP8P40818 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP8P40818 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP8P40818 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP8P40818 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP8P40818 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP8P40818 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP8P40818 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP8P40818 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP8P40818 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP8P40818 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP8P40818 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP8P40818 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP8P40818 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP8P40818 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP8P40818 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP8P40818 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP8P40818 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP8P40818 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP8P40818 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP8P40818 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP8P40818 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP8P40818 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP8P40818 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP8P40818 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP8P40818 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP8P40818 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP8P40818 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP8P40818 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP8P40818 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP8P40818 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP8P40818 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms