Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF3P20783 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF3P20783 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF3P20783 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF3P20783 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF3P20783 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF3P20783 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF3P20783 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF3P20783 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF3P20783 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF3P20783 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF3P20783 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF3P20783 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF3P20783 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF3P20783 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF3P20783 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF3P20783 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF3P20783 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF3P20783 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF3P20783 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF3P20783 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF3P20783 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF3P20783 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF3P20783 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF3P20783 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NTF3P20783 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF3P20783 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF3P20783 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF3P20783 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF3P20783 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF3P20783 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF3P20783 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF3P20783 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF3P20783 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF3P20783 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF3P20783 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF3P20783 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF3P20783 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF3P20783 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF3P20783 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF3P20783 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF3P20783 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF3P20783 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF3P20783 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF3P20783 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF3P20783 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NTF3P20783 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF3P20783 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF3P20783 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF3P20783 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF3P20783 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF3P20783 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF3P20783 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF3P20783 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF3P20783 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF3P20783 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF3P20783 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF3P20783 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF3P20783 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF3P20783 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF3P20783 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF3P20783 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF3P20783 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NTF3P20783 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF3P20783 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF3P20783 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF3P20783 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF3P20783 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF3P20783 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF3P20783 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF3P20783 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF3P20783 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF3P20783 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF3P20783 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF3P20783 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF3P20783 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF3P20783 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF3P20783 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF3P20783 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF3P20783 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF3P20783 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NTF3P20783 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF3P20783 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF3P20783 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF3P20783 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF3P20783 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF3P20783 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF3P20783 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF3P20783 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF3P20783 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF3P20783 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF3P20783 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF3P20783 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF3P20783 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF3P20783 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF3P20783 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF3P20783 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NTF3P20783 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NTF3P20783 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NTF3P20783 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms