Protein–RNA interactions for Protein: P09661

SNRPA1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPA1P09661 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SNRPA1P09661 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SNRPA1P09661 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SNRPA1P09661 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SNRPA1P09661 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SNRPA1P09661 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SNRPA1P09661 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SNRPA1P09661 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SNRPA1P09661 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SNRPA1P09661 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SNRPA1P09661 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNRPA1P09661 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNRPA1P09661 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNRPA1P09661 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SNRPA1P09661 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNRPA1P09661 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNRPA1P09661 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SNRPA1P09661 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNRPA1P09661 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SNRPA1P09661 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
SNRPA1P09661 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNRPA1P09661 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNRPA1P09661 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNRPA1P09661 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
SNRPA1P09661 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNRPA1P09661 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SNRPA1P09661 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNRPA1P09661 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SNRPA1P09661 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SNRPA1P09661 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SNRPA1P09661 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SNRPA1P09661 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SNRPA1P09661 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SNRPA1P09661 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNRPA1P09661 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNRPA1P09661 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SNRPA1P09661 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNRPA1P09661 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms