Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYNP07948 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYNP07948 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYNP07948 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYNP07948 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYNP07948 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYNP07948 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYNP07948 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYNP07948 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYNP07948 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYNP07948 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYNP07948 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYNP07948 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYNP07948 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYNP07948 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYNP07948 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYNP07948 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYNP07948 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYNP07948 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYNP07948 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYNP07948 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYNP07948 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYNP07948 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYNP07948 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYNP07948 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYNP07948 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYNP07948 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYNP07948 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYNP07948 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYNP07948 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYNP07948 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYNP07948 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYNP07948 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYNP07948 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYNP07948 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYNP07948 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYNP07948 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYNP07948 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYNP07948 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYNP07948 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYNP07948 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYNP07948 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYNP07948 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYNP07948 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYNP07948 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LYNP07948 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYNP07948 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYNP07948 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYNP07948 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYNP07948 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYNP07948 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYNP07948 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYNP07948 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYNP07948 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYNP07948 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYNP07948 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYNP07948 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYNP07948 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYNP07948 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYNP07948 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LYNP07948 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYNP07948 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYNP07948 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYNP07948 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYNP07948 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYNP07948 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYNP07948 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYNP07948 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYNP07948 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYNP07948 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYNP07948 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYNP07948 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYNP07948 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYNP07948 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LYNP07948 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LYNP07948 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYNP07948 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYNP07948 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYNP07948 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYNP07948 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYNP07948 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYNP07948 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LYNP07948 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LYNP07948 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LYNP07948 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYNP07948 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYNP07948 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYNP07948 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LYNP07948 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYNP07948 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYNP07948 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYNP07948 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYNP07948 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYNP07948 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYNP07948 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYNP07948 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYNP07948 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYNP07948 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYNP07948 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYNP07948 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms