Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-AP01891 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-AP01891 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-AP01891 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-AP01891 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-AP01891 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-AP01891 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-AP01891 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-AP01891 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-AP01891 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-AP01891 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-AP01891 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-AP01891 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-AP01891 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-AP01891 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-AP01891 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-AP01891 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-AP01891 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-AP01891 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-AP01891 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-AP01891 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-AP01891 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-AP01891 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-AP01891 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-AP01891 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-AP01891 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-AP01891 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms