Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF6BO95407 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFRSF6BO95407 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms