Protein–RNA interactions for Protein: O95347

SMC2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2O95347 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC2O95347 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC2O95347 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC2O95347 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC2O95347 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC2O95347 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC2O95347 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC2O95347 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC2O95347 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC2O95347 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC2O95347 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC2O95347 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC2O95347 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC2O95347 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC2O95347 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC2O95347 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC2O95347 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC2O95347 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC2O95347 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC2O95347 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC2O95347 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC2O95347 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC2O95347 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC2O95347 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC2O95347 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC2O95347 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC2O95347 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC2O95347 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC2O95347 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC2O95347 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC2O95347 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC2O95347 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC2O95347 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC2O95347 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC2O95347 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC2O95347 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC2O95347 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC2O95347 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC2O95347 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC2O95347 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC2O95347 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC2O95347 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC2O95347 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC2O95347 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC2O95347 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC2O95347 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC2O95347 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC2O95347 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC2O95347 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC2O95347 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC2O95347 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC2O95347 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC2O95347 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC2O95347 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC2O95347 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC2O95347 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC2O95347 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC2O95347 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC2O95347 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC2O95347 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC2O95347 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC2O95347 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC2O95347 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC2O95347 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC2O95347 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMC2O95347 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMC2O95347 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMC2O95347 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMC2O95347 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMC2O95347 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMC2O95347 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC2O95347 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC2O95347 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC2O95347 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC2O95347 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC2O95347 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC2O95347 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC2O95347 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC2O95347 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC2O95347 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC2O95347 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC2O95347 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC2O95347 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC2O95347 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC2O95347 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC2O95347 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC2O95347 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC2O95347 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC2O95347 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC2O95347 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC2O95347 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC2O95347 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC2O95347 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC2O95347 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC2O95347 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC2O95347 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC2O95347 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC2O95347 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC2O95347 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC2O95347 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms