Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCN2BO60939 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCN2BO60939 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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