Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TXNDC9O14530 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TXNDC9O14530 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TXNDC9O14530 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TXNDC9O14530 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TXNDC9O14530 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TXNDC9O14530 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TXNDC9O14530 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TXNDC9O14530 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TXNDC9O14530 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TXNDC9O14530 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TXNDC9O14530 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TXNDC9O14530 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TXNDC9O14530 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TXNDC9O14530 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TXNDC9O14530 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TXNDC9O14530 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TXNDC9O14530 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TXNDC9O14530 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TXNDC9O14530 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TXNDC9O14530 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TXNDC9O14530 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TXNDC9O14530 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TXNDC9O14530 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TXNDC9O14530 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TXNDC9O14530 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TXNDC9O14530 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TXNDC9O14530 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TXNDC9O14530 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TXNDC9O14530 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms