Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TVP23AA6NH52 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TVP23AA6NH52 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TVP23AA6NH52 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms