Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LCHNA4D1U4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms